Accepted_test

Сборка генома обыкновенной ласки (Mustela nivalis) на уровне C-скаффолдов хромосомной длины
by Азамат Тотиков | ИМКБ СО РАН, НГУ
Abstract ID: 110
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 1] Section “Fundamental and applied 3D genomics”

Обыкновенная ласка является широко распространенным мелким хищником, охватывающим весь Голарктический регион. Оценка генетического разнообразия различных популяций ласки вызывает большой интерес, поскольку отмечаются сокращения численности в некоторых локальных популяциях. Для более точного понимания генетического разнообразия необходимо наличие высококачественной сборки генома хромосомного уровня. Такие сборки возможно получить используя данные о конформации хроматина (Hi-C). Используя данные Hi-C секвенирования, мы улучшили общедоступную сборку генома обыкновенной ласки на уровне отдельных скаффолдов до хромосомного уровня, а также сопоставили номенклатуру хромосомных скаффолдов с ранее полученными данными Zoo-FISH и G-бэндинга.