Accepted_test

Поиск и описание хромосомных перестроек в хромосоме 1а у большой синицы (Parus major) с помощью метода Hi-C
by S.Y. Korableva | M.M. Gridina | A.A. Torgasheva | A. R. Nurislamov | K.S. Zadesenets | L.P. Malinovskaya | V.S. Fishman | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS; Novosibirsk State University | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS | Institute of Cytology and Genetics, SB RAS
Abstract ID: 333
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 1] Section “Fundamental and applied 3D genomics”

Аннотация

В популяции большой синицы (Parus major) был выявлен полиморфизм по комплексной перестройке в хромосоме 1А. Перестройка включает в себя инверсию и районы с вариациями числа копий, предположительно могла составлять около 3.5 Мб. Используя метод Hi-C, мы определили границу инверсии с точностью до 1000 п.о. и разработали подход, с помощью которого нам удалось найти дополнительные 15 Мб геномных последовательностей в перестроенной хромосоме 1А большой синицы.

Abstract

Polymorphism caused by complex rearrangement on chromosome 1A has been identified in the population of the Great Tit (Parus major). Сhromosomal rearrangement involves large inversion and regions with copy number variations, potentially spanning around 3.5 Mb. Using Hi-C technique we determined the inversion breakpoints with an accuracy of 1000 bp and developed an approach that allowed to discover additional 15 Mb of genomic sequences in the rearranged chromosome.