Симпозиум «Геномика, транскриптомика и биоинформатика»

Секция «Структурно-функциональная организация геномов»

Секция “Структурно-функциональная организация геномов” Симпозиума “Геномика, транскриптомика и биоинформатика” приглашает к участию с докладами по вычислительным и экспериментальным подходам к сборке и аннотации генома, определению групп сцепления, фазированию гаплотипов и сравнительной геномике.
Рассматриваемые темы включают, помимо прочего, полногеномные исследования влияния зародышевой линии и соматических вариаций геномов (полиплоидия, хромосомные аберрации, мелкомасштабные мутации, расширение повторов) на стабильность и функцию генома, а также исследования, прослеживающие эволюционную историю геномов и следствий естественного отбора.

Никита Игоревич Ершов,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия	Дмитрий Аркадьевич Афонников, ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

Секция «Регуляторная геномика»

Секция “Регуляторная геномика” Симпозиума “Геномика, транскриптомика и биоинформатика” посвящена современным достижениям в области молекулярной биологии и генетики, относящимся к пониманию механизмов регуляции работы генов и полученным благодаря синергии высокопроизводительных экспериментальных и вычислительных технологий, в том числе методов машинного обучения. В тематику секции входят:

• исследования механизмов регуляции работы генов у про- и эукариот путем биоинформатического анализа результатов высокопроизводительных омиксных экспериментов, включая методы секвенирования единичных клеток и полноразмерных молекул РНК;
• алгоритмы биоинформатики и вычислительной биологии, от сборки и аннотации геномов и транскриптомов до исследования активности регуляторных элементов генома и транскриптома и регуляторной роли некодирующих РНК;
• разработка баз данных и атласов молекулярных фенотипов организмов, клеток и тканей;
• проблемы регуляции активности генов в задачах медицинской и сельскохозяйственной генетики.

Иван Владимирович Кулаковский,  Институт белка РАН, Пущино; Институт Общей Генетики им. Н. И. Вавилова РАН, Москва; Казанский федеральный университет	Всеволод Юрьевич Макеев,  Институт общей генетики им. Вавилова РАН, Московский физико-технический институт, Москва, Россия
Виктор Георгиевич Левицкий,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия	Татьяна Ивановна Меркулова, ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

Секция «Фундаментальная и прикладная 3D-геномика»

Центральным вопросом секции «Фундаментальная и прикладная 3D-геномика» Симпозиума “Геномика, транскриптомика и биоинформатика” является обсуждение механизмов укладки хроматина и их значения с точки зрения регуляции транскрипции, репарации повреждений ДНК, делении клетки, формирования и поддержания механических свойств ядра. Помимо фундаментальных вопросов, в работе секции будет уделено внимание прикладным и методическим аспектам 3D-геномики, разработке новых вычислительных и экспериментальных подходов. Важной тематикой секции станет использование технологий захвата конформации хромосом в медико-генетических исследованиях и с целью сборки и аннотации геномов.

Александр Сергеевич Графодатский,  Институт молекулярной и клеточной биологии, Новосибирск, Россия	Вениамин Семенович Фишман,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия	Нариман Рашитович Баттулин,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

Секция «Геномная транскриптомика (дифференциальная экспрессия генов)»

В рамках секции «Полногеномная транскриптомика (дифференциальная экспрессия генов)» Симпозиума 1 “Геномика, транскриптомика и биоинформатика” будет обсуждаться полногеномное транскриптомное профилирование с использованием методов высокопроизводительного секвенирования (RNA-seq и родственных подходов), биоинформатических методов обработки данных и результаты анализа. Мы приветствуем работы, посвященные новым методам обработки данных биоинформатики, позволяющим получать качественно новые результаты и извлекать принципиально новые знания.

• Секвенирование нового поколения NGS;
• Альтернативный сплайсинг;
• Открытие SNP + Indels;
• Микрочипы (нуклеиновая кислота, белок, массив CGH, tiling array и др.).

Дмитрий Юрьевич Ощепков,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия	Михаил Павлович Пономаренко,  ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия