Симпозиум “Системная компьютерная биология”

Секция «Реконструкция, компьютерный анализ
и моделирование генных сетей и метаболических путей»

Секция «Реконструкция, компьютерный анализ и моделирование генных сетей и метаболических путей» Симпозиума «Системная вычислительная биология» посвящена различным аспектам молекулярно-генетической сетевой биологии (такие сети могут включать, помимо прочего, генные регуляторные сети, метаболические пути, пути передачи сигнала и т.д.). В рамках секции рассматриваются такие темы, как реконструкция и анализ биологических сетей, численное моделирование с использованием обыкновенных дифференциальных уравнений, уравнений в частных производных, сетей Петри и т.д., а также параметрический анализ и эволюция сетей.

Барберис Маттео
Университет Суррея, Гилфорд, Великобритания
Сергей Александрович Лашин, ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия Говорун Вадим Маркович,
НИИ системной биологии и медицины Роспотребнадзора, Москва, Россия
Илья РинатовичАкбердин
Биософт; ФИЦ Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирский Государственный Университет, Новосибирск, Россия; Университет «Сириус», Сочи, Россия
Владимир Александрович Иванисенко
Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия
Минг Чен,
Чжэцзянский университет, Чжэцзянь, Китай
Ральф Хофештадт,
Университет Билефельда, Германия

Секция «Компьютерный анализ и моделирование популяционных,
экологических и генетических систем и процессов»

На секции «Компьютерный анализ и моделирование популяционных, экологических и генетических систем и процессов» Симпозиума «Системная вычислительная биология» рассматриваются вопросы математического моделирования и компьютерного анализа популяционных, экологических и генетических систем и процессов. Основные темы включают:

  • Моделирование эволюционной динамики популяций и сообществ;
  • Анализ устойчивости биологических сообществ с учётом влияния антропогенного воздействия и изменения внешней среды;
  • Пространственно-временная динамика экосистем;
  • Популяционная генетика и эволюционные процессы.

Рассматриваются как теоретические вопросы моделирования, так и практические приложения для анализа реальных данных в области популяционной генетики, экологии и эволюционной биологии.

Ефим Яковлевич Фрисман
Институт комплексного анализа региональных проблем ДВО РАН, Биробиджан, Россия
Оксана Леонидовна Жданова
Институт автоматики и процессов управления, Владивосток, Россия

Секция «Математическая эпидемиология»

В рамках секции «Математическая эпидемиология» Симпозиума «Системная вычислительная биология» приветствуются работы по математическому моделированию распространения инфекций, включая такие направления как:

  • Непрерывные модели распространения инфекционных заболеваний на основе дифференциальных уравнений;
  • Агентные модели распространения инфекционных заболеваний;
  • Сетевые модели распространения инфекционных заболеваний;
  • Модели динамики здоровья популяции;
  • Модели эпидемиологии неинфекционных заболеваний;
  • Модели и методы оценки эффективности противоэпидемических мероприятий;
  • Примеры полевых данных и методы получения биологически мотивированных значений параметров моделей эпидемических процессов;
  • Задачи оптимального управления в здравоохранении, для решения которых использовались или могут быть использованы математические модели;
  • Искусственный интеллект в моделировании распространения инфекционных заболеваний.
Сергей Игоревич Кабанихин
Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, Новосибирск, Россия
Алексей Алексеевич Романюха,
Институт вычислительной математики им. Марчука РАН, Москва, Россия

Ольга Игоревна Криворотько, 
Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, Новосибирск, Россия