Accepted_test

Кинетические особенности взаимодействия APE1 и Polβ с ДНК и другими белками-участниками процесса эксцизионной репарации оснований ДНК
by Bakman Artemiy | Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine, SB RAS, Novosibirsk, Russia
Abstract ID: 223
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 11] Section “DNA replication and repair”

Эксцизионная репарация оснований (BER) отвечает в живой клетке за репарацию таких повреждений ДНК, как апуриновые/апиримидиновые сайты (AP-сайты), модифицированные основания, одноцепочечные разрывы. BER – это сложный, многостадийный процесс, в котором участвует ряд ферментов репарации и вспомогательных белковых факторов. В число ключевых ферментов BER у человека входят апуриновая/апиримидиновая эндонуклеаза 1 (APE1) и ДНК-полимераза β (Polβ). Для полного понимания процесса BER следует выяснить не только механизмы взаимодействия ферментов репарации с ДНК, но и их координацию между собой, которая требуется для эффективного устранения повреждений ДНК. Координация BER осуществляется за счёт множественных белок-белковых взаимодействий между участниками процесса и активно изучается исследователями в течение последних 20 лет.

С целью детального кинетического исследования процесса согласованного взаимодействия апуриновой/апиримидиновой эндонуклеазы человека APE1 и ДНК-полимеразы β c ДНК процессе эксцизионной репарации оснований было выполнено определение функциональной роли аминокислотных остатков His309, Tyr171, Arg177 и Arg181 APE1 в механизме AP-эндонуклеазной реакции и уточнение молекулярно-кинетического механизма взаимодействия APE1 с модельными ДНК-субстратами; создана чувствительная система регистрации процессов взаимодействия фермента с ДНК и другими белками BER на основе флуоресцентно меченной APE1; исследовано взаимное влияние между APE1 и Polβ в процессе BER и изучен эффект ДНК-гликозилаз на каталитическую активность Polβ.

Полученные результаты расширяют и углубляют понимание механизма каталитического действия APE1 и координации APE1, Polβ и ДНК-гликозилаз в процессе BER.