Accepted_test
В продолжение исследований производных монотерпеноидов, проявляющих противовирусное действие в отношении филовирусов, было сделано предположение, что эти молекулы могут ингибировать вирусный гликопротеин вируса Марбург (MARV GP). Был сделан вывод о том, что на поверхности тримера вирусного гликопротеина филовирусов существует дополнительный сайт связывания ингибиторов, который в случае MARV GP является основным. Такой сайт связывания может находиться в домене HR2 гликопротеинового тримера.Целью исследования стало изучение теоретической аффинности новых производных к возможному сайту связывания в домене HR2 тримера MARV GP.
Новые конъюгаты теоретически способны взаимодействовать с сайтом связывания, образованным С-концевыми участками α-спиралей домена HR2 тримера MARV GP. Наличие атома кислорода в составе морфолинового цикла новых конъюгатов существенно снижает теоретическую аффинность соединений в отношении сайта связывания домена HR2 MARV GP. Увеличение длины алифатического линкера между триазольным циклом и гетероциклом в структуре соединений, содержащих пиперидиновый и морфолиновый цикл повышает их теоретическую аффинность к рассматриваемому сайту связывания. Эта тенденция нарушается в ряду соединений с пирролидиновым циклом, соединение с самым коротким линкером демонстрирует самое низкое значение docking score в резльтате расчетов. Результаты молекулярного моделирования были подтверждены изучением ингибирующей активности новых конъюгатов в отношении псевдовирусных частиц, содержащих гликопротеин вируса Марбург.