Accepted_test

Лимфома Ходжкина: биоинформационное исследование ассоциированных генов
by Рыжакова Настасья Сергеевна | Савина Екатерина Александровна | Орлов Юрий Львович | Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России, Москва, Россия | Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России, Москва, Россия | Первый МГМУ им.И.М.Сеченова Минздрава России, Москва, Россия
Abstract ID: 295
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 2] Section “Reconstruction computational analysis and modeling of gene networks and metabolic pathways”

Мотивация и цель: Лимфома Ходжкина (болезнь Ходжкина, лимфогранулематоз) – это B-клеточное лимфоидное новообразование, составляющее примерно 10% от всех выявляемых лимфом (Georgoulis, et al., 2023). Распространенность лимфомы Ходжкина определяет актуальность исследования. Лимфома Ходжкина характеризуется реактивным полиморфоклеточным микроокружением. Этиология заболевания неизвестна. По организму распространяется метастатическим путем. К опухолевой популяции относят клетки Ходжкина, клетки Березовского-Штернберга, лакунарные, мумифицированные и LP-клетки.

Поздние осложнения терапии не только снижают качество жизни больных, как например, бесплодие, но и угрожают самой жизни излеченных пациентов при развитии последующих опухолей (Поспелова, и др., 2010) и сердечно-сосудистых заболеваний (Biccler, et al., 2019). Актуальной задачей является разработка более безопасных протоколов лечения, не имеющих таких тяжелых последствия для здоровья пациентов. Например, разработка генно-направленной терапии (Buttergereit, et al., 2002). Под генной терапией понимают лечение различных групп заболеваний путём замены поврежденных генов, изменения их экспрессии либо введения новых генов (Слободкина, et al., 2020). Для осуществления лечения методами генной терапии необходимо знать гены-мишени.

Поиск генов-мишеней для генной терапии, а также широкое биологическое исследование заболеваний осуществляется с помощью биоинформационного анализа, позволяющего найти ассоциированные с болезнью гены, изучить связь между ними, выделить целевые гены и провести анализ генных сетей.

Методы и алгоритмы: Для определения генов лимфомы Ходжкина использовались базы данных биоинформатики OMIM, NCBI GenBank, GeneOntology.org и публикации GWAS, последние версии баз данных. Списка генов анализировались с помощью ресурсов GeneCards.org и STRING-DB.org, metascape.org.

Ставилась задача определить статистически значимые категории генных онтологий для полученного списка генов лимфомы Ходжкина следующими ресурсами: PANTHER, DAVID; определить ассоциированные заболевания и произвести поиск лекарственных средств для терапии лимфомы Ходжкина с использованием базы данных MalaCards.