Accepted_test

Полногеномное секвенирование энтомопатогенной микроспоридии Tubulinosema loxostegi 2020
by Rumiantseva Arina | Efeikin Boris | Tokarev Yuri | All-Russian Institute of Plant Protection, Saint Petersburg, Russia | A.N. Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Moscow, Russia | All-Russian Institute of Plant Protection, Saint Petersburg, Russia
Abstract ID: 340
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 1] Section “Structural-functional organization of genomes and transcriptomics”

Enter brief annotation of your abstract in this text form (around 250 words)

Исследование посвящено сборке генома Tubulinosema loxostegi 2020, облигатного внутриклеточного паразита, выделенного из гусениц лугового мотылька.

Геном T. loxostegi 2020 был секвенирован с помощью платформы NovaSeq 4000 Illumina, в результате чего была получена сборка размером 7,5 МБ, состоящая из 1162 контигов, содержание GC 23,12% и значение N50 15 КБ. Сборка включала 3086 генов, в том числе 3015 генов, кодирующих белки, 8 генов рРНК и 58 генов тРНК, что сопоставимо с геномными характеристиками родственного вида T. ratisbonensis.

Сравнительный геномный анализ шести генов, кодирующих белки (гексокиназа, актин, Hsp70, ДНК-геликаза, α-тубулин и β-тубулин), показал сходство нуклеотидных и аминокислотных последовательностей в диапазоне 98-99 % и 98-100 % соответственно. Гексокиназа и ДНК-хеликаза демонстрировали более высокий полиморфизм последовательностей, что указывает на их потенциал в качестве молекулярных маркеров внутриродовой дифференциации видов.

Результаты исследования вносят вклад в геномную характеристику микроспоридий и подчеркивает полезность конкретных генов в филогенетических и таксономических исследованиях внутри рода Tubulinosema.

The thesis itself (up to 3 pages of text) should be attached as a separate file via the "Attachments" form (the buttons are located below this form on this page).
Guidelines for the thesis layout can be found here:
https://bgrssb.icgbio.ru/2024/abstracts/ (in English)
https://bgrssb.icgbio.ru/2024/ru/abstracts/ (in Russian)