Accepted_test

Филогения и филогеография Y-хромосомной гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419
by Vladimir Kharkov | Research Institute of Medical Genetics, TNMRC, Tomsk, Russia
Abstract ID: 400
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 4] Section “Human population genomics/genetics”

Проведена подробная филогения северо-евразийской гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419 с помощью полногеномного секвенирования Y-хромосом из различных филогенетических ветвей основных линий и отдельных редких образцов со специфичными YSTR-гаплотипами. Были извлечены специфичные для гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419 SNP из файлов с полногеномным секвенированием методом NGS у 202 образцов ДНК из различных популяций Сибири, Восточной Европы, Дальнего Востока, Средней Азии и Северного Кавказа. Проведен расчет возраста отдельных ветвей. Анализ STR-гаплотипов проводили с применением 45 YSTR. Детализирована филогения и территориальное распределение специфичных сублиний гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419 Y-хромосомы, за счет расширения спектра SNP. У многих образцов мужчин относящихся к сибирским и европейским популяциям было обнаружено большое количество новых, не описанных ранее SNP. По результатам выявления новых YSNP и привязке образцов к детализированным сублиниям в различных гаплогруппах был проведен расчет возраста по стандартной формуле с учетом рассчитанного ранее темпа мутирования SNP, указанного в различных статьях и на сайте YFull. Показано, что большая часть новых терминальных YSNP, в сочетании с YSTR-гаплотипами, обладает большой этно-популяционной специфичностью. Выполнено построение филогенетического древа этой гаплогруппы и медианных сетей YSTR для её различных линий. Общий возраст гаплогруппы N1a1a по всем просеквенированным образцам составил 14020 лет. Филогения гаплогруппы N1a1a1a1a-F1419 подтверждает, что местом её исходного распространения по территории Сибири и Европы была зона Южной Сибири или прилегающих территорий современной Монголии. Все образцы  характеризуется специфичным спектром гаплотипов, подчеркивающим недавний эффект основателя у различных этноспецифичных линий этой гаплогруппы. Эти результаты позволяют гораздо точнее разделить филогенетическую структуру этой гаплогруппы и точнее определить возраст их расхождения, детализировать их происхождение и связь с миграциями их носителей в прошлом.