Accepted_test

Альтернативный сплайсинг (АС) мРНК – ключевой этап посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, который обеспечивает экспрессию различных изоформ РНК. Этот механизм играет важную роль в развитии и функционировании плаценты. В качестве объекта исследования выбраны децидуальные клетки, которые имеют ключевую роль как в поддержании физиологической беременности, так и в развитии акушерских осложнений. В исследовании проведено глубокое полнотранскриптомное секвенирование с детальным анализом событий альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плацентарной ткани при физиологическом течении беременности (N=8). Для анализа событий альтернативного сплайсинга использованы программы MAJIQ, rMATS, SGSeq.

В децидуальных клетках идентифицировано с помощью программы MAJIQ 3501 событие АС для 2731 генов; с помощью программы rMATS – 66687 событий для 14784 генов; с помощью программы SGSeq – 15782 события для 5616 генов. Идентифицировано 15887 уникальных плацентарных генов, подверженных альтернативному сплайсингу, из которых 1857 генов являются общими по результатам трех различных программ. Установлено, что наиболее распространенным типом АС является пропуск экзона (46,4%).

Анализ реконструированной генной сети позволил выявить регуляторные связи, обеспечивающие координированную экспрессию большинства центральных генов, которые ассоциированы с иммунной системой, клеточной миграцией, межклеточными контактами и регуляцией экспрессии.

Полученные результаты подтверждают важность альтернативного сплайсинга, который существенно увеличивает транскрипционное разнообразие и представляет собой значимый механизм регуляции генов в децидуальных клетках. Следует отметить, что ряд генов, подверженных АС в ДК, ассоциирован с осложнениями беременности.