Accepted_test

Оболочка зерна – это основной барьер между зерном и внешней средой. Цвет оболочки зерен злаков – важный признак, он характеризует пигменты и метаболиты, содержащиеся в ней. Помимо цвета интерес представляет также и текстура зерна. При изучении механизмов генетического контроля тех или иных признаков зерна селекционеры и генетики сталкиваются с необходимостью оценки цветовых и текстурных характеристик их оболочки.

Разработанное нами ранее приложение SeedCounter показало свою практическую пользу при морфометрии зерен пшеницы и ячменя. В обновленной версии приложения SeedCounter была реализована поддержка различных протоколов съемки: с масштабированием на основе листа бумаги стандартного формата с коррекцией перспективы; на сплошном фоне с масштабированием на основе цветовой шкалы (ColorChecker Mini Classic target); на листе бумаги с цветовой шкалой. Помимо этого, в новой версии приложения был реализован расчет цветовых и текстурных характеристик зерен.

Обновленная версия приложения SeedCounter была использована для анализа краснозерных образцов озимой мягкой пшеницы. На основе нашего метода было показано, что у краснозерных сортов существуют вариации по оттенкам цвета (голубизне и светлоте). В результате этой работы наравне с двенадцатью локусами, ассоциированными с признаками устойчивости к предуборочному прорастанию, были выявлены 26 локусов, ассоциированных с цветовыми характеристиками зерен (в том числе и новые).

Помимо этого, были проанализированы изображения зерен пшеницы популяции Международной инициативы по картированию Triticeae (International Triticeae Mapping Initiative, ITMI) включающие 116 генотипов (1740 изображений). Проведенный анализ текстурных признаков продемонстрировал, что в популяции мягкой пшеницы ITMI существует разнообразие зерен по степени шершавости оболочки зерен, которое можно выявлять и анализировать на основе предложенных алгоритмов оценки текстуры зерен.