Accepted_test

Применение технологий параллельного и нанопорового секвенирования для изучения структурной организации митохондриального генома сои (Glycine max L. Merr.)
by Aleksandrovich V.V. | Siniauskaya M.G. | Institute of Genetics and Cytology, NAS, Minsk, Belarus | Institute of Genetics and Cytology, NAS, Minsk, Belarus
Abstract ID: 507
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 6] Section “Genomics, genetics and systems biology of plants”

Концепция существования митохондриального генома высших растений в виде «master circle» или мастер-хромосомы ставится под сомнение в последние годы. Все больше доказательств появляется в пользу динамической структуры растительной митохондриальной ДНК (мтДНК), которая представлена в клетке множеством линейных и кольцевых молекул, возникающим в процессе рекомбинации и перестроек генома.

Митохондриальный геном сои (Glycine max L. Merr) считается одним из сложнейших геномов среди культурных растений. В геноме G. max присутствует необычайно высокая доля длинных повторов, рекомбинация по которым приводит к возникновению, предположительно, более тысячи разных сублимонов.

В базах данных нуклеотидных последовательной имеется три сборки мтДНК культурной сои: сортов Aiganhuang и Zhonghuang 13, митохондриальный геном которых, согласно авторам, представляет собой единственную кольцевую молекулу, и мтДНК сорта Williams 82, существующей, предположительно, в виде двух кольцевых хромосом. Однако данные последовательности мтДНК не отражают возможного состояния генома митохондрий в живой клетке.

В данном исследовании была поставлена цель изучить полную нуклеотидную последовательность митохондриального генома культурной сои (G. max) с использованием двух методов секвенирования с учетом ее возможной лабильной структуры in vivo.