Accepted_test

Нашим коллегами для консультации и медико-генетического исследования был направлен пациент (девочка 16 лет) с лицевыми диморфизмами, задержкой развития, аутистических черт и тугоухости. Схожие клинические проявления обнаружены у ее брата и отца. В результате генетического исследования была обнаружена делеция 95 КБ 2p21 (chr2:45187369-45282639, GRCh37), затрагивающая только ген SIX2. На данный момент не показано участие  SIX2 в развитии головного мозга, что могло бы объяснить описанную задержку ментального развития. Однако подобные нарушения описаны для другого гена - SIX3, расположенного в том же локусе, что и SIX2 на расстоянии 14 т.п.о. от границ делеции.  Различные нарушения гена SIX3 приводят к тяжелым порокам развития головного мозга. Локус SIX2/SIX3 с точки зрения трехмерной организации хроматина состоит из двух доменов, причем гены SIX2 и SIX3 лежат в разных доменах. Обнаруженная у пациента делеция затрагивает не только ген SIX2, но и границу, разделяющую эти домены. Мы предполагаем, что делеция, обнаруженная у пациентов, может приводить к изменению пространственной организации окружающего участка ДНК, что в свою очередь может вызвать нарушение регуляции гена SIX3. Поскольку экспрессия гена SIX3 необходима на самых ранних этапах развития нервной системы для правильного формирования переднего мозга, в качестве целевой популяции клеток для оценки эффекта хромосомной перестройки данного локуса, мы используем клетки нейральных предшественников. Мы получили и проанализировали данные РНК-секвенирования в трех образцах с делецией гена SIX2 и 9 образцов нормы. Была показана достоверная корреляция между экспрессией генов SIX2 и SIX3: во всех образцах с делецией SIX2 экспрессия SIX3 значительно повышалась.