Accepted_test

Studying the of viral diversity in the Lake Baikal ecosystem using metagenomic analysis

by Bukin Yu.S. | Antipova A.Yu. | Limnological Institute SB RAS, Irkutsk, Russia | Irkutsk State University, Irkutsk, Russia

Abstract ID: 592

Event: BGRS-abstracts

Sections: [Sym 5] Section “Molecular phylogenetics and phylogenomics of Plants, Fungi, Protists, Prokaryotes and Viruses”

Вирусы являются важным компонентом водных экосистем. Концентрация вирусоподобных частиц в пресноводных водоемах достигает до 10¹¹ на миллилитр. Одним из наиболее перспективных методов исследования вирусов является шотган метагеномный анализ. Цель нашего исследования заключалась в анализе таксономического и функционального разнообразия ДНК вирусов в воде озера Байкал и разнообразия ДНК и РНК вирусов, ассоциированных с байкальскими ракообразными амфиподами путем анализа метагеномных данных.

Viruses are an important component of aquatic ecosystems. The concentration of virus-like particles in freshwater bodies reaches up to 1011 per milliliter. One of the most promising methods for studying viruses is shotgun metagenomic analysis. The purpose of our study was to analyze the taxonomic and functional diversity of DNA viruses in the water of Lake Baikal and the diversity of DNA and RNA viruses associated with Baikal amphipod crustaceans by analyzing metagenomic data.