Accepted_test

Использование инструмента MaxQuant для поиска бимаркеров БАР
by Людмила Смирнова | Томский НИМЦ
Abstract ID: 597
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 10] Section “Neuroimaging and genotyping technologies for the diagnosis of neuropsychiatric disorders; methods of disease correction based on feedback technology; brain-computer interface technologies”

Основной задачей нашего исследования явился поиск биомаркеров специфично характеризующих разные клинические разновидности БАР и оценка возможности применения этих маркеров в клинической практике. Для этого был использован популярный в протемике инструмент MaxQuant. С его помощью в сыворотке крови больных БАР было идентифицировано более 1200 белков, большинство из которых принимают участие в регуляции транскрипции и дифференцировке клеток, а также являются регуляторами широкого спектра сигнальных путей. Самой представленной функцией оказалась регуляция иммунного ответа. Наибольшее значение LFQ было у белка Serotransferrin (iBAQ 1883900 LFQ 3330900000). Серотрансферрин может играть роль в регуляции клеточной подвижности и пролиферации и этот белок уже ассоциирован с БАР. Белок, показавший наименьший LFQ это белок Protein S100-A7 (ген S100A7, iBAQ  98804 LFQ 528540). Это нейроспецефичный белок, который входит в группу уникальных для нервной ткани кальций-связывающих белков. Таким образом, использование популярного поискового инструмента MaxQuant при работе с сывороткой крови, выявляет в основном белки широко представленные в сыворотке крови. Для поиска специфичных минорных белков надо использовать более чувствительные программы