Accepted_test

Реконструкция и статистические оценки генных сетей комплексных заболеваний на основе онлайн инструментов биоинформатики
by Волков Игорь Алексеевич | Анашкина Анастасия Андреевна | Туркина Василиса Алексеевна | Савина Екатерина Александровна | Орлов Юрий Львович | Первый МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия | Институт молекулярной биологии им. В.А.Энгельгардта РАН, Москва, Россия | Первый МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия | Первый МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия | Первый МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия
Abstract ID: 717
Event: BGRS-abstracts
Sections: [Sym 2] Section “Reconstruction computational analysis and modeling of gene networks and metabolic pathways”

Волков И.А. 1, Анашкина А.А.1,2, Туркина В.А.1*, Савина Е.А. 1,2, Орлов Ю.Л.1,3*

1 Первый МГМУ им. И.М.Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет), Москва, Россия

2 Институт молекулярной биологии им. В.А.Энгельгардта РАН, Москва, Россия

3 Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия

*kaparos@list.ru, orlov@bionet.nsc.ru

Ключевые слова: медицинская информатика, медицинская генетика, онкология, комплексные заболевания, генные онтологии, генные сети, образование

Исследование генных сетей комплексных заболеваний является важной задачей биомедицины, требующей интеграции данных. Бурный рост данных технологий секвенирования следующего поколения (NGS next generation sequencing) требует разработки новых методов анализа, процессинга и предварительной обработки данных секвенирования с использованием математических и статистических методов, включая реализацию программ для клиник, для врачей, с удобным интерфейсом. Несмотря на существующий широкий набор компьютерных программ в мире, для решения конкретных задач анализа клинических данных в России, необходима их адаптация, в том числе создание биоинформационных методик, учебных пособий и обучающих элементов для студентов, интернов и ординаторов медицинских учреждений. Отработка методики реконструкции генных сетей важна как для поиска генов-мишеней для терапии, так и развития биоинформационных методов, поиска новых учебных решений для образования. Представлен научный проект исследования комплексных заболеваний, в которых сложно выделить генетические компоненты, включая в том числе ментальные расстройства, шизофрению, болезнь Паркинсона. Практические цели проекта - разработка специализированных компьютерных программных модулей для реконструкции и анализа генных сетей комплексных заболеваний, которые могут быть использованы для задач цифрового образования и повышения квалификации, подготовки студентов биомедицинских и биоинженерных специальностей.